The Use of Vegetative Compatibility Tests for Identification of Biodiversity of Phytopathogenic Fungi
Primena testova vegetativne kompatibilnosti za identifikaciju biodiverziteta fitopatogenih gljiva
View/ Open
Author
Krnjaja, Vesna
Levic, Jelena
Stankovic, Slavica
Vasic, Tanja
Keywords
Vegetative compatibilityPhytopathogenic fungi
Genetic diversity
VCGs
Vegetativna kompatibilnost
fitopatogene gljive
genetički diverzitet
Metadata
Show full item recordAbstract
Visual assessment of phenotypes, performed when two strains of one fungal species
are cultivated in a mixed culture on specific media, is known as vegetative or heterokaryotic
compatibility or incompatibility test, which enables identification of fungal clones and their
classification based on phylogenetic groups. Hyphae of strains that have identical alleles at
all vic loci can anastomose into a form of a visible heterokaryon. Strains that divide compatible
loci and can anastomose each other belong to a subpopulation termed the vegetative
compatibility group (VCG), which is genetically distinguishable from other VCGs. Each VCG
is specific regarding its host plant or related host groups and can, but does not have to be
virulent on other hosts.
Vegetative compatibility can be established in different ways, but complementary
auxotrophic strains or strains formed by spontaneous mutation during nutrition, capable
of forming a prototrophic heterokaryon are predominantly used. The nit mutants are
considered excellent genetic markers for determination of vegetative compatibility and
grouping of strains or clones of one fungus into the same or different VCGs. The ability
only to determine whether strains are the same or not, but not the degree of their relatedness
using VCG, is a limiting factor in analyses that could be performed. VCGs are the
most efficient when they are employed to detect the presence of a specific strain in a
population.
This paper provides an overview of the importance of the phenomenon of vegetative
compatibility. Vegetative compatibility is one of the most important genetic
traits in ascomycetes by which one subpopulation can be identified as a distinct genetic
group. Furthermore, the procedures for isolation, identification and determination of
nit mutant phenotypes, and for identification of complementary strains and VCGs are
described in detail. Vizuelna ocena fenotipa koja se izvodi kada se dva izolata ili soja jedne vrste gljive gaje
u združenim kulturama na specifičnim podlogama, poznata kao test vegetativne ili heterokarionske
kompatibilnosti ili nekompatibilnosti, omogućava identifikaciju klonova gljive
i njihovu klasifikaciju prema filogenetskim grupama. Hife izolata koje imaju identične alele
kod svih vic lokusa mogu da anastomoziraju u oblik vidljivog heterokariona. Izolati koji dele
kompatibilne lokuse i mogu da anastomoziraju jedni s drugima pripadaju subpopulaciji
označenoj kao vegetativno kompatibilna grupa (VCG) koja je genetski odvojena od drugih
vegetativno kompatibilnih grupa (VCGs). Svaka VCG je specifična prema biljci domaćinu ili
srodnoj grupi domaćina i može ili ne mora biti virulentna na drugim domaćinima.
Vegetativna kompatibilnost može biti utvrđena na različite načine, ali se najčešće koriste
komplementarni auksotrofni sojevi, ili sojevi koji su nastali spontanom mutacijom tokom ishrane,
a koji su sposobni da obrazuju prototrofni heterokarion. Smatra se da su nit mutanti izvrsni
genetički markeri za utvrđivanje vegetativne kompatibilnosti i grupisanje sojeva ili klonova jedne
vrste gljive u iste ili različite VCGs. Nesposobnost da se odredi stepen srodnosti korišćenjem
VCGs, već samo da li su izolati isti ili ne, ograničava tipove analiza koje bi mogle biti postavljene.
VCGs su najefikasnije kada se koriste za utvrđivanje prisustva specifičnog soja u populaciji.
U radu je dat pregled značaja fenomena vegetativne kompatibilnosti, kao jedne veoma
značajne genetičke osobine kod askomiceta kojom se jedna subpopulacija može identifikovati
kao posebna genetička grupa. Isto tako, dat je detaljan opis postupka za izolaciju, identifikaciju
i utvrđivanje fenotipa nit mutanata, kao i za identifikaciju komplementarnih sojeva i VCGs.